Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crmp1P97427 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crmp1P97427 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms