Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig3P97386 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig3P97386 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig3P97386 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig3P97386 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig3P97386 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig3P97386 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lig3P97386 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig3P97386 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms