Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b3P97370 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms