Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sec1P97353 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec1P97353 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sec1P97353 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec1P97353 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms