Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms