Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim43bP86448 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim43bP86448 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43bP86448 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms