Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gabpb2P81069 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms