Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx1P81068 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx1P81068 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms