Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms