Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cct7P80313 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cct7P80313 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms