Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms