Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb6P70689 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb6P70689 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms