Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sparcl1P70663 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sparcl1P70663 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms