Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9xP70398 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9xP70398 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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