Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rad50P70388 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad50P70388 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms