Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msx3P70354 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms