Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smad1P70340 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad1P70340 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms