Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tbx6P70327 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tbx6P70327 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tbx6P70327 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms