Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp7P70280 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms