Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb4bP68372 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms