Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp3P63024 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms