Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Prrx1P63013 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrx1P63013 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms