Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uba52P62984 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uba52P62984 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms