Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vsnl1P62761 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vsnl1P62761 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vsnl1P62761 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms