Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23aP62751 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms