Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps18P62270 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps18P62270 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps18P62270 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps18P62270 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms