Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copz1P61924 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copz1P61924 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms