Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Depdc5P61460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Depdc5P61460 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms