Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms