Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap25P60879 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snap25P60879 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap25P60879 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap25P60879 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap25P60879 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms