Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps5P59438 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps5P59438 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms