Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcif1P59114 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcif1P59114 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcif1P59114 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms