Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhbdl3P58873 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhbdl3P58873 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdl3P58873 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms