Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P58686 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P58686 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P58686 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P58686 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P58686 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P58686 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P58686 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms