Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn4P58404 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn4P58404 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Strn4P58404 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strn4P58404 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms