Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf16P58334 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf16P58334 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf16P58334 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms