Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snrpa1P57784 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpa1P57784 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms