Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdcd5P56812 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd5P56812 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms