Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ephb4P54761 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ephb4P54761 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ephb4P54761 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms