Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms