Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fdft1P53798 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fdft1P53798 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms