Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lhx4P53776 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx4P53776 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms