Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pold1P52431 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pold1P52431 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pold1P52431 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pold1P52431 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms