Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec1P51908 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec1P51908 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec1P51908 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms