Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XpcP51612 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XpcP51612 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XpcP51612 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XpcP51612 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XpcP51612 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XpcP51612 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XpcP51612 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XpcP51612 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XpcP51612 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XpcP51612 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XpcP51612 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XpcP51612 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XpcP51612 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XpcP51612 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XpcP51612 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XpcP51612 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XpcP51612 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XpcP51612 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XpcP51612 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XpcP51612 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XpcP51612 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms