Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Defa-rs12P50716 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs12P50716 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs12P50716 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms