Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TspoP50637 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TspoP50637 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TspoP50637 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TspoP50637 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TspoP50637 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TspoP50637 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TspoP50637 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TspoP50637 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TspoP50637 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TspoP50637 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TspoP50637 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TspoP50637 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TspoP50637 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TspoP50637 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TspoP50637 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms