Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FmodP50608 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FmodP50608 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FmodP50608 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FmodP50608 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FmodP50608 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FmodP50608 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FmodP50608 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FmodP50608 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms