Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms