Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma2P49722 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma2P49722 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma2P49722 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms